اولویت­‌بندی موضوعات و پیشران‌­ها با توجه به ظرفیت­‌های موجود در کشور و مبتنی بر نیازهای معین شده در نظام مسایل بر روی طرح­‌های جمع‌­آوری شده انجام می‌­پذیرد.
ارزیابی­‌های مدون در سه سطح انجام می­‌پذیرد:
سطح اول: ارزیابی ورود، شامل تایید مقدماتی طرح ارایه شده جهت ورود به فرایند ارزیابی (براساس اولویت­‌بندی، ارزش نسبی فنی طرح و تطابق طرح با موضوعات کشاورزی و کاربردهای آن.)
سطح دوم: ارزیابی اولیه، شامل ارزیابی کلی طرح
سطح سوم: ارزیابی فنی، شامل ارزیابی جامع طرح
عناصر و گزاره­‌های کلیدی در ارزیابی هریک از طرح‌­ها براساس چک لیست جامع طراحی شده که به‌پیوست این گزارش ارایه گردیده است. گزارشات ارزیابی طرح‌‏ها در قالب تصویب شده در کارگروه ارزیابی با حضور کارشناسان قرارگاه تهیه و تدوین می­‌گردد. مهمترین سرفصل‏‌های گزارش ارزیابی به شرح زیر است:

• معرفی شرکت (گروه یا هسته) و محصول یا خدمت، تاریخچه فعالیت، معرفی اعضای کلیدی شرکت، معرفی اعضای هیئت مدیره، ترکیب سهامداران و ساختار سازمانی
• بررسی ویژگی­‌های محصول یا سرویس شرکت
• بررسی فرآیند مورد نیاز برای اجرای طرح و ارزیابی زیرساخت‌های موجود شرکت
• بررسی بازار شامل اطلاعات مربوط به حجم بازار، رقبای داخلی و خارجی شرکت و نکات مربوط به ساز‌و‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌کار تجاری سازی محصول نهایی
• بررسی­‌های مالی شامل بررسی شاخص­‌های درآمدی و هزینه‌ه­ای به صورت سالیانه برای طرح­‌های سرمایه گذاری
• بررسی صورت‌های مالی در طرح های اعطای تسهیلات و یا مشمول حمایت
• پیشنهاد سرمایه گذاری شامل مبلغ مورد نیاز، سهام قابل واگذاری و برنامه اجرایی طرح (گانت‌چارت و کش‌فلو)
• جمع بندی شامل بیان نکات منفی و مثبت طرح و نتیجه­‌گیری در خصوص سرمایه گذاری بر روی طرح و ارائه پیشنهاد جدید سرمایه گذاری